提供家庭、长者及学生健康服务

提供儿童体能智力测验服务

提供法医服务

负责港口卫生及旅游健康事宜

设立美沙酮诊所

提供牙医及中医药服务

登记专业医护机构的注册

进行控烟工作

进行卫生防护工作

提供健康教育

管制医疗仪器

2016年7月20日香港卫生署表示，其临床信息管理系统的免疫接种记录系统怀疑被黑客入侵，初步调查显示，黑客曾在7月10日至11日期间，破解系统的信息保安设施，将外来可疑档案上载至服务器内，入侵系统。约17000个病人档案被黑客“一览无遗”甚至恐遭外泄。