希腊古生物学家奥尔维茨，在研究大穿山甲的头骨时，在它的两个眼孔上方发现了一个小孔，这一小孔与两个眼孔成品字形排列，这引起他很大的兴趣。经过反复研究，这个小孔被证实是退化的眼眶。这一发现轰动了整个生物界，此后，各国的生物学家纷纷加入研究行列。各项研究结果表明，鱼类、两栖类、爬行类、鸟类、哺乳动物，甚至包括人类都有三只眼睛。

在十七世纪，法国哲学家笛卡尔认为松果腺体是灵魂所在的位置，是灵魂与肉体结合的地方，现代科学的说法是，松果腺体是分泌血清素及褪黑激素的重要腺体。血清素及褪黑激素可调整睡眠、体温情绪、青春期及卵巢的周期，提高免疫系统活力和消除自由基的作用，治疗糖尿病及骨质疏松症等。由于松果腺体是人体第六内分泌腺体，当松果腺体分泌正常时，它会控制其他第一至第五内分泌腺体，例如男女的性腺、肾上腺、胰岛腺、胸腺、甲状腺等。松果腺体依据对光的感应来制造褪黑激素，光线越多其分泌量就越少。有些动物的松果腺，是由皮肤直接感应光线。人类的松果腺深埋在大脑内，所以是由眼睛接收光的信息。不论通过哪一种管道，这个腺体与太阳升落同步作业，是控制睡眠周期的关键。